사천왕과 배틀을 정해진 순서대로 하던 전 세대의 포켓몬 게임과 달리, 주인공이 도전할 사천왕을 골라 고른 순서대로 싸울 수 있다. 이 때 경우의 수는 24가지.
네 명의 사천왕들과의 배틀을 마치면 포켓몬리그 가운데의 조각상을 이용하여 챔피언의 방에 들어갈 수 있다. 하나지방의 챔피언은 노간주(B2W2에서는 아이리스)이며, 1차 엔딩에서는 노간주와 배틀하지 않는다. 그리고 전당등록을 할려면 게치스를 이기면 된다. 반면 B2W2에서는 1차 엔딩에서 아이리스와 배틀을 할 수 있다.